| S.No | Enstitiü Adı | Program Adı |
| 1 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Biyosistem Mühendisliği Yüksek Lisans Programı |
| 2 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Bitki Koruma Yüksek Lisans Programı |
| 3 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Bahçe Bitkileri Yüksek Lisans Programı |
| 4 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Biyoloji Yüksek Lisans Programı |
| 5 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Gıda Mühendisliği Yüksek Lisans Programı |
| 6 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Elektrik Elektronik Mühendisliği Yüksek Lisans Programı |
| 7 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Matematik ve Fen Bilimleri Yüksek Lisans Programı |
| 8 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Kimya Yüksek Lisans Programı |
| 9 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Tarımsal Biyoteknoloji Yüksek Lisans Programı |
| 10 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Kimya Mühendisliği Yüksek Lisans Programı |
| 11 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Tarla Bitkileri Yüksek Lisans Programı |
| 12 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Zootekni Yüksek Lisans Programı |
| 13 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Fizik Yüksek Lisans Programı |
| 14 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Matematik Yüksek Lisans Programı |
| 15 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Kimya Doktora Programı |
| 16 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Kimya Mühendisliği Doktora Programı |
| 17 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Tarla Bitkileri Doktora Programı |
| 18 | Fen Bilimleri Enstitüsü | Matamatik Doktora Programı |
| 19 | Sosyal Bilimler Enstitüsü | Eğitim Yönetimi Yüksek Lisans Programı |
| 20 | Sosyal Bilimler Enstitüsü | Eğitim Yönetimi Doktora Programı |
| 21 | Sosyal Bilimler Enstitüsü | Eğitim Programları ve Öğretimi Yüksek Lisans Programı |
| 22 | Sosyal Bilimler Enstitüsü | Maliye Tezli Normal Öğretim Yüksek Lisans Programı |
| 23 | Sosyal Bilimler Enstitüsü | Maliye Tezli İkinci Öğretim Yüksek Lisans Programı |
| 24 | Sosyal Bilimler Enstitüsü | Maliye Tezsiz Normal Öğretim Yüksek Lisans Programı |
| 25 | Sosyal Bilimler Enstitüsü | Yakınçağ Tarihi Yüksek Lisans Programı |
| 26 | Sağlık Bilimleri Enstitüsü | Veterinerlik İç Hastalıkları Yüksek Lisans Programı |
| 27 | Sağlık Bilimleri Enstitüsü | Veterinerlik Cerrahisi Doktora Programı |
| 28 | Sağlık Bilimleri Enstitüsü | Beden Eğitimi ve Spor Yüksek Lisans Programı |
Siirt Üniversitesi yüksek lisans ve doktora